本剧试图从科学的角度对咒语、降头、轮回、邪教、心灵感应、异度空间、复活以及不死之身等不可思议的现象进行理性的解释，导人相信科学、摆脱封建迷信的倾向明显。剧情扑朔迷离很是精彩，但看后总有有头无尾的感觉，原因在于本剧对于一些现象的解释却并不自圆其说，给人“为解释而解释”的牵强附会之感。比如，第一个神像咒语的故事解释了神像的纹路与风是唱片与唱针的关系，因而可以催眠人，却没有解释（或者说没法解释）为什么五千年前的人类可以用比钻石还要硬的这种材料制造出这座神像。又如，李子健可以由于人格分裂而认为自己是其大哥李子超，但为何他能看见真实地发生在哥哥身上的事情？再如，前世今生的故事解释了阿儿由于潜移默化而产生精神分裂，致使她自认为是阿恩，并对阿恩生前的故事了如指掌，从而造成了阿儿的前生是阿恩的错觉，但却没有解释，阿恩为什么也有前生的记忆？世界上无法解释的事情实在太多，以至到了后面的不死身等故事，编剧都懒得解释了。
主角高永贤是一名大学教授，主张以理性的科学态度去对待世界
整理《迷离档案》之前的故事线
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