故事开始于墓地，当外面响起枪声时，霍雷肖·凯恩正在教堂里向牧师忏悔。虽然破案了，但也为这一季的结束奠定了基础。这一季增加了一些关于CSIer的故事，埃里克·德尔科与大麻事件有关，并被内政部调查。Ryan Wolfe在一次调查中被针头射中眼睛，影响了他的视力。霍雷肖·凯恩因外遇结识了埃里克的妹妹玛丽，并最终结婚。这一季的主题是实验室里出现了一只鼹鼠，这只鼹鼠也引起了实验室里的恐慌，这只痣将出现在第25集。此外，第25集也为下一季奠定了基础，因为第一集中出现的帮派为霍雷肖复仇并枪杀了他的妻子。由于联邦调查局的干预，团伙成员被带到巴西，霍雷肖和埃里克决定效仿，将他绳之以法。